5-O-(4,4-dimetoksitritil)uridinas 丨CAS 81246-79-9

5-O-(4,4-dimetoksitritil)uridinas yra apsaugotas nukleozidas, plačiai naudojamas oligonukleotidų sintezėje. Jo 5′-hidroksilo grupė yra blokuojama dimetoksitritilo (DMT) apsaugine grupe, kuri leidžia kontroliuojamą laipsnišką RNR ir DNR sekų surinkimą ant kietų atramų naudojant fosforamidito chemiją. Šis junginys yra svarbus automatinės oligonukleotidų sintezės blokas, leidžiantis įterpti uridino liekanas tam tikrose RNR arba DNR grandžių vietose. Jis naudojamas ruošiant antisensinius oligonukleotidus, mažas trukdančias RNR (siRNR), mikroRNR, aptamerus ir kitas modifikuotas nukleorūgštis, naudojamas terapiniuose tyrimuose, diagnostikoje ir molekulinės biologijos tyrimuose. Be savo vaidmens nukleotidų surinkime, 5-O-(4,4-dimetoksitritil)uridinas dažnai naudojamas žymėtų arba modifikuotų nukleino rūgščių sintezei tiriant genų ekspresiją, baltymų ir nukleorūgščių sąveiką bei RNR struktūrinę analizę.

Pagrindinis 5-O-(4,4-dimetoksitritil)uridino pranašumas yra jo gebėjimas užtikrinti tikslią, laipsnišką oligonukleotidų sintezę. DMT apsauginė grupė yra stabili standartinėmis reakcijos sąlygomis, bet gali būti selektyviai pašalinta švelniai rūgščiomis sąlygomis, leidžianti kontroliuoti nukleotidų grandinių pailgėjimą. Šis stabilumas užtikrina aukštą sujungimo efektyvumą ir sumažina nepageidaujamas šalutines reakcijas sintezės metu. Be to, junginys suteikia universalumo, kurį galima įtraukti į chemiškai modifikuotus arba funkcionalizuotus oligonukleotidus, palaikant terapinių ir tyrimų priemonių, pasižyminčių padidintu stabilumu, surišimo afinitetu arba cheminėmis savybėmis, kūrimą. Jo suderinamumas su automatizuotais sintezatoriais supaprastina didelio masto ir atkuriamų oligonukleotidų gamybą. Apskritai tai padeda tyrėjams ir gamintojams pasiekti aukštą derlių, sekos tikslumą ir nuoseklumą sudėtingose ​​nukleorūgščių rinkiniuose.